全国“扫黄打非”工作小组隶属于中央宣传思想工作领导小组，由中央宣传部、中央统战部、中央政法委、中央网信办、中央台湾工作办公室、国务院办公厅、最高人民法院、最高人民检察院、教育部、工业和信息化部、公安部、国家安全部、民政部、财政部、住房和城乡建设部、交通运输部、文化和旅游部、海关总署、国家市场监管总局、国家广播电视总局、国家版权局、中国民用航空局、国家邮政局、中共北京市委、中央军委政治工作部、中国铁路总公司等26个部门组成。全国“扫黄打非”工作小组办公室设在中央宣传部。

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